Оперативний метод застосовується переважно для видалення вульгарних папілом. В даному випадку метод є досить ефективним.
Кріодеструкція ефективна при видаленні рідким азотом підошовних, плоских, вульгарних папілом. При великому розмірі елементів може знадобитися повторна операція.
Діатермокоагуляція полягає в припіканні струмами високої частоти, які викликають коагуляцію (загибель) білків в місці дії і омертвінні тканини. Використовується для видалення ниткоподібних, вульгарних і підошовних папілом. Недолік у тому, що немає можливості контролю глибини впливу, у зв'язку з чим може бути опік сусідніх тканин при недостатній глибині впливу на необхідній ділянці.
Лазерний. Цей спосіб вважається найбільш оптимальним. Він дає можливість видаляти на будь-якій глибині, запобігає кровотечі, не залишає рубців. Вплив лазером застосовується для видалення простих і підошовних папілом.
Радіохірургічний. Цей метод не менш популярний, ніж лазерний. Ділянку тканини розсікають спеціальним радіохірургічним скальпелем. Метод виключає повторне виникнення папіломи.