Одонтогенну кісту видаляють попередньо викроївши трапецієподібний слизиво-надкістничний клапоть за зубодесневим краєм і далі по альвеолярному відростку до перехідної складки. Після видалення оболонки кісти знімають антигенний шар цементу з кореня зуба і заповнюють кісткову порожнину, що утворюється гідроксиапатитом, слизиво-надкістничний клапоть укладають на місце і зашивають.